祭神は「素盞嗚尊」。当社は延喜式神名帳（九〇五年〜九二七年）に載る古社で起源は奈良朝時代に鎮座されていたものと推測される。永禄三年（一五六〇年）三好長慶が飯盛山に居城した頃には飯盛城鎮護の神として崇敬も厚かった。御机神社古案内文には「・・・・・古くは現在地の東方字宮地に有ったが文禄年間（一五九二年〜一六九六年）に字城の堂山に移し更に元禄十三年（一七〇〇年）にこの地に移転したものである」と記されている。現在の社殿は明治十四年に建てかえられたものである。